Baseado na manga de Naoya Matsumoto, o anime Kaiju nº 8 conta a história do jovem Kafka Hibino, que passou sua infância acompanhando o mundo desmoronar após o surgimento de criaturas ameaçadoras conhecidas como Kaiju. Ao lado de sua melhor amiga, Mina Ashiro, os dois prometeram que ao crescer iriam se tornar membros da Força de Defesa do Japão e derrotar a ameaçadora presença dos monstros. Mas com o passar dos anos, as circunstâncias da vida os forçaram a seguir caminhos diferentes. Enquanto Hibino trabalha na Monster Sweeper, Inc., uma empresa de limpeza profissional especializada em lidar com a sujeira das batalhas contra Kaiju, Mina Ashiro agora é a capitã da 3ª Divisão da Força de Defesa. O sonho de infância do jovem é relembrado quando conhece Reno Ichikawa, que possui uma determinação incansável de se juntar à Força de Defesa e não deixa espaço para o fracasso. Sua perseverança influencia a ambição de Kafka de estar ao lado de Mina enquanto protegem a humanidade dos Kaiju juntos.