Em um corpo humano devastado por maus hábitos, trilhões de células lutam para manter o sistema funcionando. Cells at Work! Code Black mostra o lado sombrio da vida interna, onde glóbulos vermelhos e brancos enfrentam ameaças como estresse, álcool e doenças. A cada episódio, a sobrevivência se torna mais difícil, e o sacrifício, inevitável.