El Candidato acompanha Wayne Addison (James Purefoy), um oficial veterano da CIA que retorna ao México para derrubar o traficante de drogas mais perigosos do país: Rafael Bautista (Joaquín Cosio). Addison conta com a ajuda de Isabel Alfaro (Eréndira Ibarra), uma agente de campo novata que, ao longo da missão, entra em conflito com Lalo Yzaguirre (José María de Tavira), seu ex-namorado e o atual prefeito da Cidade do México. Além do vínculo com Alfaro, Lalo é o político mais honesto e inspirador das bandas mexicanas. Poder, dinheiro e amor se misturam nessa arriscada jornada.