Orphan acompanha um jovem judeu de 12 anos chamado Andor que descobre suas verdadeiras origens durante o complexo e intenso levante húngaro contra o regime comunista do país. O ano é 1957 e a jornada dolorosa do garoto começa quando um homem aparece afirmando ser seu pai após anos sendo alimentado por histórias idealizadas de um pai falecido contadas por sua mãe. O mundo do menino vira de cabeça para baixo enquanto ele também fica ciente do passado e dos segredos que resultaram na sobrevivência de sua mãe durante a Segunda Guerra Mundial.