Em Little Trouble Girls, uma escola católica mantém um coral feminino com integrantes do ensino médio. Aos 16 anos, Lucia conhece a veterana Ana-Maria e passa a questionar suas crenças e valores. Com a sexualidade aflorada, um retiro de final de semana aumenta as dúvidas de Lucia sobre sua atração pela garota mais velha e por um homem mais velho da cidade que visitam. A fuga do sentimento acaba afetando os relacionamentos ao redor das duas e até mesmo a harmonia presente nas apresentações do coral.