A Anatomia dos Cavalos se passa no século XVIII, mais especificamente no ano de 1781, ano em que Ángel Pumacahua, um revolucionário derrotado, retorna para seu povoado no alto dos Andes peruanos. Coincidentemente, do espaço, um meteorito realiza o mesmo caminho e acaba deixando uma enorme cratera ao redor da vila de Ángel. Quando o homem chega no território, é o século XXI que o dá boas-vindas. O passado e o presente coexistem enquanto uma pastora de lhamas chamada Eustaquia está em busca de sua irmã desaparecida que todos do povoado acredita ter sido esmagada pelo meteoro. Enquanto Ángel ajuda Eustaquia a mobilizar as autoridades capazes de encontrar sua irmã, todos se perguntam que tipo de revolução ainda existe hoje.