Em O Botânico, um menino solitário de origem cazaque chamado Arsin nutre apenas memórias esquecidas de sua família. O garoto encontra consolo e alento em sua relação com as plantas. A chegada de uma jovem e espirituosa menina chinesa da etnia Han chamada Meiyu é como descobrir uma nova e rara planta para Arsin. O comportamento imprevisível e bem-humorado de Meiyu traz um senso de admiração em Arsin. Juntos, eles formam uma amizade bonita e profunda, na qual, apesar de bastante diferentes, os dois parecem crescer e se entender no pequeno mundo que compartilham, sonhando com o imenso oceano que existe para além da comunidade onde moram. Um dia, Arsin descobre que Meiyu vai se mudar para Shanghai, quilômetros de distância do pequeno vilarejo em Xinjiang onde vivem. Meiyu se muda para a cidade enquanto Arsin fica para trás, enfrentando os silêncios e as mudanças do frágil e mágico universo que dividiam.
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