Dirigido por Pavel Giroud, Comandante Fritz acompanha o jovem Fritz, um oficial da Stasi que é enviado para a capital cubana em uma missão de frustrar um possível ataque da CIA durante uma cerimônia. No entanto, ao chegar na cidade localizada na costa cubana que foi um presente de Fidel Castro a Alemanha Oriental - para fortalecer os laços de amizades entres os estados socialistas -, ele descobre que nada seria como o planejado. Com a missão ficando cada dia mais difícil, ele logo conhece Lola, uma cubana misteriosa e encantadora, capaz de trazer calor aos seus dias mais sombrios.