Uma releitura da saga de Neon Genesis Evangelion, onde anjos destrutivos e robôs imbuídos espiritualmente (EVA). Porém, agora a organização paramilitar NERV perde a sua utilidade. Sem defesa, eles são atacados pela SEELE, que usa suas unidades de produção em massa de Evangelion, em uma tentativa de concluir o Projeto de ...