- O diretor Mathieu Kassovitz trabalhou na adaptação do livro de Maurice G. Dantec por cinco anos;
- Vin Diesel desistiu de protagonizar Hitman - Assassino 47 (2007) para estrelar Missão Babilônia;
- Vincent Cassel esteve cotado para atuar no filme;
- Gérard Depardieu foi dublado no filme;
- Em março de 2007 as filmagens foram paralisadas por duas semanas, devido a problemas na construção dos sets de filmagens e também com o clima na República Tcheca;
- A 20th Century Fox cortou 70 minutos da versão original planejada pelo diretor Mathieu Kassovitz, de forma que o filme tivesse 90 minutos;
- Devido à briga entre Mathieu Kassovitz e o estúdio, Missão Babilônia praticamente não teve divulgação nos Estados Unidos;
- A versão lançada em alguns países europeus, como França e Alemanha, tem 101 minutos;
- O orçamento de Missão Babilônia foi de US$ 60 milhões.